Věříme, že je důležité vytvářet přátelské sousedské vztahy mezi Čechy a Němci. 

Kancelář je srdcem Česko-německého fondu budoucnosti – sem přicházejí všechny žádosti o podporu projektů. Radou i sdílením zkušeností se žadateli se snažíme přispět k tomu, aby se česko-německému sousedství dařilo.

Pod vedením jednoho českého a jednoho německého ředitele či ředitelky zde pracuje angažovaný tým referentů a referentek z obou zemí. Sledujeme pozorně česko-německé vztahy, vymýšlíme nové programy a výzvy a chystáme různé akce pro veřejnost. Především však zkoumáme, zda si předkládané projektové žádosti zaslouží podporu, dohlížíme na průběh projektů a na závěr kontrolujeme vyúčtování poskytnutých prostředků. Připravujeme také čtvrtletní zasedání správní rady, na kterém se rozhoduje o schválení žádostí o podporu projektů.

Oba ředitelé jsou na návrh příslušného ministra zahraničí jmenování správní radou na dobu čtyř let.

Správní rada rozhoduje o zásadních otázkách směřování Fondu a rovněž o podpoře většiny projektů. Na návrh ministerstev zahraničních věcí jmenuje českého a německého ředitele či ředitelku kanceláře.

Do správní rady jmenují ministři zahraničí obou zemí osobnosti, které se dlouhodobě věnují česko-německému dění. Jejich funkce je čestná a mandát je dvouletý. Jako nezávislé grémium rozhoduje ve své vlastní zodpovědnosti, schází se čtyřikrát do roka, z toho alespoň jednou ročně v Německu.

Dozorčí rada kontroluje, zda jsou finanční prostředky Fondu budoucnosti vynakládány účelně a zda jsou i další finanční záležitosti fondu v pořádku.

Dozorčí rada dohlíží na dodržování pravidel při kontrole vyúčtování projektů, hospodaření fondu a nakládáním s jeho majetkem. Dva její čeští a dva němečtí členové jsou jmenováni ministry zahraničí a jejich funkce je čestná.